金華市熱啟動Taq酶研發(fā)
發(fā)布時間：2023-03-22 01:32:53
金華市熱啟動Taq酶研發(fā)
分子診斷儀器主要包括核酸提取儀、PCR 擴增儀、核酸分子雜交儀、基因芯片儀和基因測序儀等。在技術(shù)相對容易攻破的中端儀器領(lǐng)域，如核酸提取儀、PCR 擴增儀、核酸分子雜交儀、基因芯片儀國產(chǎn)化已經(jīng)成型，國產(chǎn)產(chǎn)品占據(jù)了主要市場，而 基因測序儀的國產(chǎn)化進程正在發(fā)起突圍，主要表現(xiàn)為三種方式： （1）并購國外的測序儀公司，在其核心技術(shù)的基礎(chǔ)上推出自主品牌的測序儀，以華大基因為代表。（2）利用內(nèi)生科研能力自主研發(fā)，以華因康基因、紫鑫藥業(yè)等公司為代表。（3）與國外知名測序儀生產(chǎn)企業(yè)合作，在其測序儀原型的基礎(chǔ)上加以改造，形成具有特殊用途的自主品牌的測序儀，代表公司是貝瑞和康、達安基因和博奧生物等。
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相對分子質(zhì)量為94的Taq DNA聚合酶的活性較高，大約為200000 U/mg，在合成DNA時有一個較高的適溫度75～80℃。Taq DNA聚合酶雖然在90℃以上合成DNA的能力有限，但高溫時仍比較穩(wěn)定。有實驗證明，在92.5℃、95℃和97.5℃時，PCR混合物中的Taq DNA聚合酶分別經(jīng)130 min、40 min和5～6 min后，仍可保持百分之50左右的活性，其半衰期較長。所以，在一個PCR預(yù)備試驗中，每次循環(huán)時上限溫度為95℃處理20S，則循環(huán)50次后Taq DNA聚合酶仍可保持百分之65的活性，能夠保證實驗的需要。
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由于應(yīng)用領(lǐng)域廣泛，分子診斷行業(yè)在全球得到了飛速發(fā)展。隨著靶向治療逐漸成為腫瘤準(zhǔn)確治療的重要方法，釋放更多腫瘤個性化用藥檢測（伴隨檢測）需求。新靶向藥不斷推出和個性化用藥檢測滲透率提升，推動了個性化用藥檢測行業(yè)的快速發(fā)展。基因測序已在無創(chuàng)產(chǎn)前檢測（NIPT）大規(guī)模應(yīng)用，并基于全 面二孩政策推動需求快速增長。未來隨著技術(shù)進步和成本下降，基因測序在腫瘤早篩和個人基因組檢測領(lǐng)域中應(yīng)用前景更廣。
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在PCR反應(yīng)早期，產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別，而后熒光的產(chǎn)生進入指數(shù)期、線性期和終的平臺期，因此可以在PCR反應(yīng)處于指數(shù)期的某一點 上來檢測PCR產(chǎn)物的量，并且由此來推斷模板初的含量。為了便于對所檢測樣本進行比較，在real-time Q-PCR反應(yīng)的指數(shù)期，首先需設(shè)定一定熒光信號的域值，一般這個域值（threshold）是以PCR反應(yīng)的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號 （baseline），熒光域值的缺省設(shè)置是3～15個循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認(rèn)為是真 正的信號，它可用于定義 樣本的域值循環(huán)數(shù)（Ct）。Ct值的含義是：每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明，每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的 對數(shù)存在線性關(guān)系，起始拷貝數(shù)越多，Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線，因此只要獲得未知樣品的Ct值，即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出該樣 品的起始拷貝數(shù)。
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選擇靈敏度高的熱啟動Taq酶。一般說，Taq酶的擴增效率高，靈敏度就高，但也有不一致的情況。如果要擴增的樣本目標(biāo)基因豐度較低，建議對Taq酶的擴增靈敏度進行檢測。常見的檢測方法是將目標(biāo)基因質(zhì)粒片段進行10倍或5倍梯度稀釋，在較低的幾個稀釋度進行PCR檢測，選擇檢測靈敏度較高的熱啟動Taq酶。目前國內(nèi)市場上常用的ABI、Bioline、Biog的擴增靈敏度都比較高，但知名品牌T的靈敏度略低，研究者可根據(jù)自身的實驗要求進行選擇。